土木电气工程系建立于2011年8月，目前有土木工程、建筑环境与设备工程、电气工程及其自动化、工程管理、水利水电工程、测控技术与仪器、建筑学、建筑电气与智能化等八个本科专业，现有在校生1745名。土木电气工程系各专业依托扬州大学建筑科学与工程学院、能源与动力工程学院设置，依靠母体学科支撑，坚持立足江苏，辐射周边，服务全国，紧紧围绕地方经济建设和社会发展培养人才。多年来，各专业已积累了丰富的办学经验，拥有完善的教学条件、教学管理和质量监控机制，为国家和地方的建筑、道路、桥梁、交通、水利、电力等行业的设计院（所）、施工企业和政府管理部门，输送了1484名专业技术和管理人才，每年都有一批毕业生考取国内外高校研究生，办学质量受到社会好评。